一、二者的功效不一样：
1、洁净工作台的功效：根据离心风机将气体吸进预过滤装置，经过静压箱进到高效送风口过虑，将过虑后的气体以竖直或水准气旋的情况送出，使实际操作地区做到千级洁净度等级，确保生产制造对自然环境洁净度等级的规定。
2、生物生物安全柜的功效：是避免实验过程处理方式中一些带有危险因素或不明性生物粒子产生大气气溶胶散逸的箱形空气过滤负压力保险装置。
二、二者归类不一样：
1、洁净工作台的归类：关键分两大类，一类是水准层.流，另一类是竖直层.流。依据实际操作构造分成单侧实际操作及多边实际操作二种方式，按其主要用途又可分成一般洁净工作台和生物洁净工作台。
2、生物生物安全柜的归类：依照NSF49规范，生物安全等级1级（P1）的媒质就是指一般没害病菌、病毒感染等微生物；生物安全等级2级（P2）的媒质就是指一般性可发病病菌、病毒感染等微生物；生物安全等级3级（P3）的媒质就是指最烈/致命细菌、病毒感染等微生物，但感柒后可痊愈；
生物安全等级四级（P4）的媒质就是指最烈/致命细菌、病毒感染等微生物，感柒后不容易痊愈。此规范将生物生物安全柜分成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ级，可适用不一样生物安全等级媒质的实际操作。
三、二者的主要用途不一样：
1、洁净工作台的主要用途：洁净工作台是一种出示部分洁净无菌检测办公环境的单边流形空气过滤机器设备。适用医疗卫生、生物制药业、食品类、医药学科学试验、电子光学、电子器件、无菌车间试验、无菌检测微生物检测、绿色植物组培技术打疫苗等必须部分清洁无菌检测办公环境的科学研究和生产制造单位。
也可组合成装配生产线具备低噪音、可移动化等特性。它的应用对改进加工工艺标准,提升产品品质和扩大良品率均有显著成绩。
2、生物生物安全柜的主要用途：广泛运用于微生物学、生物医药学、基因工程技术、生物产品等行业的科学研究、课堂教学、医学检验和生产制造中，是试验室生物安全性中安全防护天然屏障中基本上的安全性防护设备。
